中醫藥學，作為中華民族智慧的結晶，不僅是中國古代科學的一顆璀璨明珠，更是開啟中華文明寶庫的關鍵鑰匙。自澳門科技大學創立以來，便將中醫藥視為其核心發展領域之一。2000年建校之初即設立了中醫藥學院，並推出了中醫學學士學位課程，後續又根據澳門特區大健康產業發展需求推出了中藥學學士學位課程。目前，學院已建立了完整的從本科到博士的教育體系，包括中醫、中藥、中西醫結合碩士和博士學位課程，為澳門乃至更廣泛的地區培養了大批中醫藥專業人才，推動了行業的持續進步。

澳門科技大學建校於二零零零年，同年設立中醫藥學院，現已成為澳門特區唯一擁有完整中醫藥教育課程體系的高等學府，包括中醫學和中藥學本科教育課程，及中醫學、中藥學、中西醫結合碩士和博士研究生教育課程，博士後研究工作站等。 

一九九九年澳門回歸後，特區政府致力發展高等教育，為澳門特區的社會和經濟發展儲備人才資源，科大中醫藥學院由此應運而生。二零零年建院伊始，學院率先開辦了五年全日制中醫學學士課程，開創了澳門中醫藥高等教育的先河，也是澳門中醫藥發展史上的重大里程碑。隨後又創辦了中藥學本科學位課程，及中醫學、中藥學、中西醫結合碩士和博士學位課程，二零一一年建立了中藥質量與創新藥物研究博士後工作站，標誌著澳門擁有了完整的中醫藥高級人才培養體系。現今，學院已成為我國中醫藥高等教育的重要組成部分，也是中國內地和澳門特區中醫藥教研合作的重要基地。學生除來自本澳外，也有許多內地的有志青年前來求學。許多本地畢業生成為了澳門中醫藥隊伍新的生力軍，倍受廣大市民贊許；許多內地生畢業後，繼續在港澳及海內外教研機構深造，或回內地參加全國中醫執業考試而從業。